ヒト細胞アトラス(HCA)、40以上の研究成果を発表—細胞の理解を飛躍的に進展

ヒト細胞アトラス(Human Cell Atlas: HCA)コンソーシアムの研究者たちは、健康と疾患におけるヒト細胞の理解を深めるための重要な進展を報告しました。2024年11月20日、Nature誌およびその他のNatureポートフォリオ誌において、40以上の査読付き論文を集めた特集コレクションが公開されました。本コレクションは、HCAが推進する大規模データセット、人工知能(AI)アルゴリズム、生物医学的発見を包括的に紹介しており、ヒトの細胞生物学に対する理解を一変させる可能性を秘めています。

本特集には、胎盤や骨格の形成メカニズム、脳の成熟過程、腸管や血管の新しい細胞状態、COVID-19による肺の変化、遺伝的変異が疾患に与える影響など、多岐にわたる研究が含まれています。これらの成果は、細胞アトラスの構築方法を大規模に示すものであり、HCAが目指す「ヒト細胞の完全なマップ」の実現に向けた重要な一歩となります。

 

HCAのミッション:ヒト細胞の詳細なマッピング

HCAは、シングルセル解析や空間ゲノミクスの実験・計算手法を駆使し、ヒトのすべての細胞を包括的にマッピングすることを目指しています。この基盤をもとに、健康状態の理解、疾患の診断、モニタリング、治療の進展が期待されています。現在までに、100か国以上の3,600人以上のHCA研究者が協力し、10,000人以上のドナー由来の1億以上の細胞をプロファイリングしています。現在、初の「ヒト細胞アトラス」の草案を作成しており、最終的には数十億の細胞をマッピングする計画が進行中です。

本特集コレクションでは、HCAのミッションにおける3つの主要な進展が強調されています。

 

成人組織および臓器のマッピング

発生過程におけるヒト組織のマッピング

AI/機械学習を活用した新たな解析手法の開発

HCAの研究者たちは、18の生物学的ネットワーク(Biological Networks)に分かれ、それぞれ特定の臓器、組織、またはシステムに焦点を当てています。

 

研究ハイライト:細胞マップが明らかにする新たな生物学的知見

本コレクションには、疾患理解を深める重要な研究が多数含まれています。

 

1. 腸の細胞アトラス:炎症性疾患の鍵を解明

健常および疾患組織から腸の細胞アトラスを構築し、新たな腸細胞のタイプを特定(Oliver et al.)。

この細胞タイプは、潰瘍性大腸炎やクローン病の炎症に関与する可能性があり、将来的な治療ターゲットとなる可能性を示唆。

 

2. 骨格の発生過程:関節炎の原因に迫る

ヒト骨格の発生に関する初の詳細なマップを作成(To et al.)。

骨の形成プロセスを解明し、関節炎の起源や骨疾患の理解に貢献。

 

3. 胎盤の多オミクス解析:胎児の成長と保護の仕組みを解明

胎盤の第1三半期における遺伝プログラムを解析(Shu et al.)。

胎盤が栄養供給と免疫保護をどのように制御しているかを詳細に明らかにし、胎児発育異常の研究基盤を提供。

これらの発生生物学的研究は、健康な発生過程の時間的・空間的な理解を深めるだけでなく、疾患の起源を探るためのリソースとなり、新たな治療法の開発に役立つ可能性を示しています。

 

多様性と倫理:公平な科学を目指して

HCAは、多様な人々の細胞を網羅することを重視しています。ある研究では、これまで研究対象として過小評価されていた集団を含めることの重要性を指摘し、公平な科学を推進するための原則と行動指針を提案しています(Amit et al.)。

また、HCAの倫理ガイドライン策定の役割についても触れられており、ゲノミクス研究における倫理的課題に対する新たな提言が示されています(Kirby et al.)。

 

AIが細胞研究を加速:新たな解析手法の導入

HCAの研究では、AIが細胞分類と解析を革新しています。

 

類似性(Heimberg et al.)

シングルセルデータを比較し、異なる組織に共通する細胞タイプを特定できる新手法を開発。

「画像検索」のような手法を用いて細胞を検索し、生物学的コンテキストを統合的に解析。

細胞の階層的分類(Ergan et al. / Fischer et al.)

 

細胞を階層的に分類するための新しい手法を開発し、細胞アノテーションの精度を向上。

これらの技術は、個別化医療や再生医療の進展にも寄与し、新たな疾患診断技術や治療法の開発につながると期待されています。

 

まとめ

HCAは、ヒト細胞の包括的なリファレンスマップを作成し、医療と生命科学の発展に貢献するグローバルな取り組みです。今回の特集コレクションは、疾患の理解、個別化医療、創薬研究、再生医療など、さまざまな分野に影響を与える重要な研究をまとめたものです。

HCAの共同議長であるサラ・タイヒマン教授(ケンブリッジ幹細胞研究所)は、「HCAは、健康な人体の包括的なマップを作成することで、病気の変化を検出し、理解するための基準を確立します。これにより、より正確な診断、新たな創薬、先進的な再生医療の基盤が築かれます」と語っています。

 HCAの研究成果は、診断から創薬・治療法開発まで、医学の革新を加速する鍵となるでしょう。

 

[News release] [Nature Portfolio] [Nature Editorial]

この記事の続きは会員限定です