まず､いくつかの主要用語を定義し､区別しておくことが重要である｡まず､｢targeted proteomics｣と｢discovery proteomics｣であるが､｢discovery proteomics｣は､がんその他の疾患と関連している可能性のあるごく少数の｢バイオマーカー｣を突き止めることを目的として大量の発現タンパク質､それも未知のものも多いタンパク質を解析するためにMS技術を利用する研究者の分野の用語である｡

発見したバイオマーカーは､試験によって検証され､理想としては最終的に疾患の診断観察のアッセイとして臨床に採用される｡臨床現場で複数のバイオマーカーを解析する場合には､臨床医が､研究者によって疾患の状況の指標として検証済みの特定のバイオマーカーを探し､定量化する作業を行うもので､｢targeted proteomics｣と呼ばれる｡

HRM-MS™ (2) は､スイスのチューリッヒに本社を置く次世代プロテオミクス界をリードするBiognosys AG で開発された次世代ハイコテント･プロテオミクス技術である｡

HRM-MSは､データ非依存性情報収集 (DIA) により､一回の稼働で同時に何千種ものタンパク質の再現性の高い精密な定量化が可能である｡Biognosys社によれば､HRM-MS™ は､創薬や高度多重化タンパク質定量化の用途に最適なプロテオミクス法である｡

 Biognosysis社によると､HRM-MS™ の特長の一つは､サンプル測定の時には重要と分かっていなかった､あるいは重要と考えられていなかったタンパク質やタンパク質アイソフォームも含めて､標的タンパク質の遡及的解析が可能だということである｡

どんな時点でもスペクトル･ライブラリーの改善や拡大をオフラインで展開し､HRM測定の再解析に充てることができる｡また､サンプルそのものの保存の代わりに､サンプルのタンパク質シグナルをデジタル･データとしてDigital Biobank®に保存する｡従って､サンプル中のタンパク質を将来的に解析することになる場合も､最初に一度測定すればいいだけである｡

 The Xpresys® Lung Testは､2013年10月に市場に発表された｡この製品は､簡単な採血だけで､肺結節 (ILNs) が良性かどうかを示す発現のシグネチャーの手がかりとなる複数のタンパク質の解析と定量化を行う｡この検査製品は､ワシントン州シアトル市に本社を置くIntegrated Diagnostics, Inc. (INDI) 社で製造されたもので､三重四極 (MS/MS) 質量分析計との組み合わせで市場化される多重標的プロテオミクス検査製品としては初めてのものである｡

この検査は､5種のバイオマーカー･タンパク質と､アッセイの正規化に用いられる6種のタンパク質を同時に分析評価する｡この検査製品にはMRM-MS技術が採用されている｡

 カナダとカリフォルニアを拠点に事業を展開するBiodesix, Inc.は､がん患者の治療成果向上のために血液検査による診断検査法の開発と商品化を行う分子診断法開発企業である｡同社は､最近には､VeriStrat®と名付けられた血漿プロテオミクス検査製品を発表した｡この製品は､非小細胞肺がん (NSCLC) 患者の治療改善のため､疾患の予後や経過の予想に必要な情報などを含めて､がん専門医が治療に必要な情報を得ることができる｡

 2015年7月29日､Biodesix社は､｢Biognosys社との協定に達した｡Biognosys社は､同社のBiognosys HRM-MS技術をBiodesix社のコンパニオン診断開発の一部として供与し､がん治療市場の新しいタンパク質アッセイ開発に充てることになる (10)｣と発表している｡Biognosys社のHRM-MSは､次世代ハイコンテント･プロテオミクス技術であり､何千種ものタンパク質を高再現性高精度で定量化し､患者タイプ別グループの臨床的に有意味な差異の判定を助けるものである｡

 2015年2月27日付Genome Web (11) の報道によれば､マサチューセッツ州ピッツフィールド所在のNuclea Biotechnologies社が､2015年後半にMSアッセイ製品を発表し､臨床プロテオミクス市場参入を計画しているとのことである｡NucleaのPresident､Patrick Muraca CEOは､Genome Webに対して､同社が､MSによる天然インスリンと医療用類似体の定量化検査製品と2型糖尿病用MS検査製品の臨床有効性検証を進めていると語った｡

最近､同社は､Thermo Fisher Scientific's BRIMS Center勤務経験のある6人の研究者を採用したと発表している｡このことは､Nuclea社がR&D中心の事業から製品販売への事業へと脱皮を図っていること､また同社が初めてMSを用いた検査製品の発表を計画しており､その足固めに力を入れていることを示している｡ 

 2015年1月9日付Genome Web の報道によると (12)､ユタ州ソルト･レーク･シティに本社を置く女性ヘルス･ケア企業､Sera Prognostics社が､今年後半にMRM-MSプロテオミクス検査製品 (PreTRM™) の発表を計画している｡この製品は､現場の医師が妊娠女性の未熟児出産リスクをするものである｡Sera社は､同社の三重四極MRM-MSを用いているCLIAラボを通してPreTRM検査製品を提供していく予定になっている｡

Genome Webは､検査製品が予定通りに発表されるという前提で､三重四極MRMを用いた多重プロテオミクス検査製品は､2013年に発表されたXpresys Lung Test以来ようやく2つめだと述べている｡

 2015年6月26日付Genome Web (14) は､カリフォルニア州サンディエゴ市に本社を置くApplied Proteomics, Inc., (API) が､当初MRM-MS基本の検査製品を計画していたが､診断検査製品として､先にELISAを用いた大腸がん (CRC) 8タンパク質パネルの開発を決定したと報道している｡同社は､ゆくゆくはこのMRM-MSによる診断検査製品を開発する考えを変えていないが､商品化にはまだ時間がかかると見ている｡

API社のCSO､Dr. John Blumeは､GenomeWebに､｢しかし､この分野の将来は絶対に質量分析にある｣と語り､同氏もAPI社も､今後､診断がさらに高度に多重化されたプロテオミクス検査法に移行してゆき､質量分析が一般化するだろうと考えている｡

 このレポートは完全なものではないが､臨床プロテオミクスの分野で期待感が高まっていることをはっきりと描けたのではないか｡MSを用いたプロテオミクス技術の臨床応用は人々が期待したほど速やかには進まなかったが､過去2,3年の間にこの分野の技術が大きく前進している｡