ヒトゲノム解析で世界をリードするdeCODE GeneticsがNature Geneticsオンライン版に新しい地平を切り開く4本の研究論文を発表した。この論文はアイスランド各地の10万人を対象にした全ゲノム・シーケンス・データに基づいている。deCODE研究チームが執筆したこの研究論文は、最新のDNAシーケンシング技術を駆使して、これまででもっとも詳しい一国の住民のDNA像を描き出した。
2015年3月25日付けの4本のNature Genetics 掲載論文の首席著者であり、deCODEの設立者で現在CEOを務めるKari Stefansson, M.D.は、｢この研究は、人類の歴史を探り、疾患の診断、治療、予防の新しい手段を開発する上で他にはないシーケンシングの効力を示すものになった｣述べ、さらに、｢また、私たちのような少数の人口でも、大多数の市民の善意の協力があれば世界の科学と医学の前進に貢献できることを示している。
その点で、この研究は分子レベルの国家的自画像にとどまらない。まれな疾患の正確な診断、アルツハイマーなどの疾患のリスク因子や創薬標的の発見、通常一対を組んでいるゲノムの世界で相手を持たないY染色体が父親から息子に遺伝する際に自己修復する仕組みを突き止めるなど、私たちの研究は多大な貢献をしてきた。他の国でも国家規模のシーケンス・プロジェクトの立ち上げ準備を始めている。そういう国に対してプロジェクトの成果は莫大だと伝えたい｣と結んでいる。
4本のNature Genetics掲載論文とその要点を下記に紹介する。
｢Large-Scale Whole-Genome Sequencing of the Icelandic Population｣は、deCODEが、国民の総合的な家系を使って、国民のシーケンス・データが少ない地域まで正確に割り出せることを実証しただけでなく、これまでの診断を改善する新しい発見や重要データなどの貢献をしている。
｢Identification of a Large Set of Rare Complete Human Knockouts｣は、ヒト遺伝子ノックアウトの頻度と有用性とを調べている。遺伝子の役割や健康に与える影響の研究は、何十年も前からマウスを対象に遺伝子のノックアウトまたはスイッチオフの実験が続けられてきた。しかし、まれな突然変異で遺伝子がノックアウトされている人を見つければどうだろう、ということから、大規模かつ詳細なdeCODEのデータを使い、1000個を超えるノックアウト遺伝子を突き止めた。調査した104,000人のうち8%近くでこのような形の遺伝子ノックアウトがあった。その人々個人の健康その他の特質を調査することで人の生活現象に及ぼす遺伝子の影響を直接調べる手段が得られ、新しい医薬や診断法を開発する上で役立つ可能性がある。
｢The Y-Chromosome Point Mutation Rate in Humans｣は、5万年を超える男系を対象に研究し、人間の男性性染色体の突然変異率を詳しく正確に推定している。この突然変異率を進化時計の一種として、歴史上の事件やヒト種の進化、ヒトの社会の進化の時期を特定することができる。たとえば、現在の全世界のY染色体の最後の共通の祖先はざっと239,000年ほど前に遡り、他の方法による推定よりも10万年近く時代を下っており、母親から子供に伝えられるミトコンドリアDNAすべての最後の共通の祖先の年代にかなり近づいている。
｢Loss-of-Function Variants in ABCA7 Confer Risk of Alzheimer's Disease｣では、ヨーロッパのいくつかの国とアメリカでも複製が発見されているアルツハイマーのまれではあるが強力なリスク因子について述べている。
アイスランドのレイキャビク (写真) に本社を置くdeCODEは、ヒトゲノム解析と理解の分野で世界をリードしている。同社は独特の経験と住民資源を活かし、何十という数の一般的疾患の遺伝的リスク因子を発見した。同社は、疾患の遺伝的因子を研究し、得られた情報を利用して新しい診断、治療、予防法の開発を目指している。また、deCODEは、Amgenの100%子会社である。
｢Genomes of Icelanders｣に焦点を当てたNature Geneticsの発行はIlluminaが援助しており、IlluminaのDirector of Scientific Researchを務めるElliott H. Margulies, Ph.D.の推薦文が添えられている。推薦文は、( http://www.nature.com/ng/focus/icelanders/sponsor.html ) に掲載されている。
原著へのリンクは英語版をご覧ください
deCODE Shows Power of Iceland Population Sequencing
