一般的な感染症であるが、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）―通称“ゴールデンスタフ”―が血流に入ると、敗血症を引き起こし、生命に危険を及ぼす可能性がある。ゴールデンスタフは、抗生物質に対する耐性を持つことで悪名高く、これにより治療が困難となり、耐性菌に感染した患者の健康への悪影響が増加している。2023年9月12日に「Cell Reports」で公開されたこの分野で最も包括的な研究の1つで、ピーター・ドハーティ感染症・免疫研究所（Doherty Institute）を中心とする研究者チームは、1300以上のゴールデンスタフ株のユニークな遺伝的プロファイルを分析した。
このデータを患者情報や抗生物質情報と組み合わせることで、患者の要因が死亡リスクを決定する上で重要である一方で、特定の遺伝子が抗生物質の耐性、さらには抗生物質や免疫系を逃れて血中に留まるバクテリアの能力と関連していることが明らかになった。公開された論文のタイトルは「A Statistical Genomics Framework to Trace Bacterial Genomic Predictors of Clinical Outcomes in Staphylococcus aureus Bacteremia（黄色ブドウ球菌の敗血症における臨床的結果の細菌ゲノム予測因子を追跡する統計ゲノミクスフレームワーク）」である。
メルボルン大学のジュリエリ・ステファノ博士（Dr. Stefano Giulieri）は、Doherty Instituteの医師・研究者であり、この論文の第一著者である。彼は、臨床データとゲノムデータを統合する診断的な力を強調し、「私たちが知る限り、我々が使用した方法、つまりゲノム全体関連研究（GWAS）を用いて、バクテリアのゲノム、宿主の要因、抗生物質が黄色ブドウ球菌敗血症の進行に及ぼす影響を深く探るのは、これが初めてである」と述べています。
「GWASでは、科学者は大量のバクテリアのゲノムをスキャンして、抗生物質耐性などの特定の特性を持つ株により頻繁に現れる微小な変化（変異）を探します。統計的に強い関連性を持つ変異は、バクテリアが患者の結果に重要な属性を取得する方法を解明するための貴重な手がかりです」と彼は語ります。
「私たちの研究は、重篤なゴールデンスタフ感染の背後にある複雑な遺伝的ダイナミクスをより深く理解することを明らかにしました。それは、細菌の全ゲノムシーケンス、臨床データ、そして洗練された統計ゲノミクスを組み合わせることで、感染結果に影響を及ぼす臨床的に関連する細菌の要因を発見する潜在能力を示しています」と彼は付け加えています。
メルボルン大学のハウデン・ベン博士（Professor Ben Howden）は、Doherty Instituteの微生物診断ユニット（MDU）公衆衛生研究室のディレクターであり、この論文の共同上級著者である。彼は、「ゴールデンスタフの抗生物質耐性に責任を持つ遺伝子を明らかにすることで、私たちのGWASは科学界に、ゴールデンスタフの血流感染症を治療するための効果的なソリューションを開発するためのより明確なターゲットを指し示しています」と述べています。
「この知識は、これらの持続的な感染症に取り組む能力を形成し、向上させる可能性があります。細菌のゲノムが臨床ルーチンでますます利用可能になるにつれて、私たちは、感染菌の独自の遺伝的構成に合わせた治療が可能となり、すべての人々を同じ方法で治療するのではなく、カスタマイズされた治療戦略に近づいています」とハウデン博士は述べました。
