ライム病の新たな治療標的を見つける”地下鉄マップ”
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タフツ大学医学部の科学者たちは、ライム病の原因となる細菌の主要な代謝活動を示すゲノムスケールの代謝モデル、別名「地下鉄マップ」を開発しました。このマップを使用して、彼らは宿主への感染にのみ使用される経路を選択的に標的とする2つの化合物を特定することに成功しました。彼らの研究は2023年10月19日にmSystems誌に掲載されました。オープンアクセスの記事のタイトルは「Metabolic Modeling Predicts Unique Drug Targets in Borrelia burgdorferi（代謝モデリングがボレリア・ブルグドルフェリにおけるユニークな薬物標的を予測する）」です。
どちらの薬も多くの副作用があるためライム病の治療には適していませんが、計算上の「地下鉄マップ」を使用して薬物標的と可能性のある既存の治療法を予測することに成功したことは、他の有益な細菌に影響を与えることなく、ライム病のみをブロックする微小物質を開発することが可能であることを示しています。
ゲノムスケールの代謝モデル（GEM）は、遺伝子、酵素、代謝物質、その他の情報を含む生物システムに関するすべての既知の代謝情報を収集します。これらのモデルは、大規模なデータと機械学習を使用して、科学者が分子メカニズムを理解し、予測を立て、以前は未知であり、既知の生物学的プロセスに反するかもしれない新しいプロセスを特定するのに役立ちます。
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