「音を外した」病気の細胞を見つけ出す!画期的な計算ツールCHOIRとは?

「音を外した」病気の細胞を見つけ出す!画期的な計算ツールCHOIRとは?

サイエンス出版部 発行書籍

まるで壮大な合唱団のように、私たちの体中の細胞は完璧なハーモニーを奏でることで健康を維持しています。しかし、もし一部の細胞が「音を外して」しまったら、そのハーモニーは乱れ、体全体に広範な影響を及ぼしかねません。科学者たちは、この不協和音を奏でる細胞を特定することで、それらを再び調和させ、健康を取り戻す方法を学べるかもしれません。この音楽的な比喩から着想を得て、グラッドストーン研究所の研究チームは、「音を外した」細胞の検出を改善できる「CHOIR」という画期的な計算ツールを発表しました。CHOIR(choir: cluster hierarchy optimization by iterative random forestsの略)は、何千、何百万もの細胞を生物学的に異なるグループに分類し、病気の原因となりうる特定の細胞タイプや状態の特定を助けます。 「CHOIRが素晴らしいのは、既存のツールが抱える重要な限界のいくつかを解決してくれる点です」と語るのは、グラッドストーン研究所の研究員であり、2025年4月7日に『Nature Genetics』誌でCHOIRを発表した新しい研究の責任著者であるライアン・コーセス博士(Ryan Corces, PhD)です。「CHOIRは希少な細胞タイプをより正確に特定できるだけでなく、他のツールが陥りがちな、実際には生物学的に区別できない細胞タイプを『幻視』してしまう傾向も回避できます」。この論文は、「CHOIR Improves Significance-Based Detection of Cell Types and States from Single-Cell Data(CHOIRはシングルセルデータからの細胞タイプと状態の有意性に基づく検出を改善する)」と題されています。 「この新しいツールを使えば、これまで見過ごされて

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Edited by Michael D. O'Neill

Michael D. O'Neill

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