創薬の金脈！培養土壌に眠る「微生物ダークマター」から新抗生物質を発見！培養不要のゲノム解析技術とは

私たちの足元に広がる土壌。そこには、未来の医療を大きく変える可能性を秘めた「宝」が眠っているかもしれません。実は、多くの抗生物質はもともと微生物から発見されました。しかし、薬剤耐性菌の拡大という深刻な問題に直面する一方で、新薬の開発は停滞気味です。その原因の一つは、ほとんどの細菌が実験室では培養できないことでした。この課題を乗り越えるため、研究者たちは土の中に眠る膨大な微生物の「金脈」にアクセスする画期的な方法を開発しました。 彼らのアプローチは、2025年9月12日に『Nature Biotechnology』誌で発表され、これまで謎に包まれていた微生物のゲノム（全遺伝情報）を解き明かし、新たな創薬の可能性を切り開くものとして注目されています。 この研究は、オープンアクセス論文「Bioactive Molecules Unearthed by Terabase-Scale Long-Read Sequencing of a Soil Metagenome（土壌メタゲノムのテラベーススケールのロングリードシーケンシングによって発掘された生理活性分子）」と題されています。 研究チームは、たった一つの森林土壌サンプルから、これまでに全く知られていなかった数百もの細菌の完全なゲノム情報を生成し、さらに2つの新しい抗生物質の候補を発見しました。この成果は、培養不可能な細菌から新薬の候補を大規模に探索する道筋を示し、私たちの環境を形成している広大で未開拓な微生物の世界を明らかにするものです。 「私たちはついに、これまで人類がアクセスできなかった微生物の世界を垣間見る技術を手に入れたのです」と、ロックフェラー大学遺伝子コード化低分子研究所の所長であるショーン・F・ブレイディ博士（Sean F. Brady, PhD）は語ります。「そして、単に情報を見ているだけではありません

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