ヤマモモ育種に革命：完全参照ゲノムと果実品質遺伝子の発見
中国原産のヤマモモ、Myrica rubraは、その独特な風味と栄養価、経済的価値で高く評価されています。しかし、これまでのゲノム解析では配列の連続性が欠けており、包括的な遺伝子研究が妨げられていました。そこで、ヤマモモの果実品質に影響を与える遺伝因子の詳細な調査が必要でした。
国家生物化学脅威管理重点研究室の研究者らは、画期的な発見を行いました。彼らの研究は、2024年1月30日にHorticulture Research誌に発表されました。この研究では、「Zaojia」品種のテロメアからテロメアまでの完全な参照ゲノムの組み立てと、ヤマモモの果実品質に影響を与える遺伝因子を明らかにするゲノムワイド関連解析（GWAS）を報告しています。
この研究では、PacBio HiFiロングリードを用いて「Zaojia」品種の292.60 MbのT2Tゲノムを組み立て、ゲノムの連続性を大幅に向上させました。研究者らは、6,649,674の一塩基多型（SNP）を特定し、173のアクセスションでGWASを実施し、1,937のSNPを28の果実品質特性に関連する1,039の遺伝子に結びつけました。特に、染色体6上のSNPクラスターが果実の色を調節し、アントシアニンの生成を増加させる2つのMYB遺伝子とMLP様タンパク質遺伝子が関与していることが判明しました。
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