中国原産のヤマモモ、Myrica rubraは、その独特な風味と栄養価、経済的価値で高く評価されています。しかし、これまでのゲノム解析では配列の連続性が欠けており、包括的な遺伝子研究が妨げられていました。そこで、ヤマモモの果実品質に影響を与える遺伝因子の詳細な調査が必要でした。
国家生物化学脅威管理重点研究室の研究者らは、画期的な発見を行いました。彼らの研究は、2024年1月30日にHorticulture Research誌に発表されました。この研究では、「Zaojia」品種のテロメアからテロメアまでの完全な参照ゲノムの組み立てと、ヤマモモの果実品質に影響を与える遺伝因子を明らかにするゲノムワイド関連解析（GWAS）を報告しています。
この研究では、PacBio HiFiロングリードを用いて「Zaojia」品種の292.60 MbのT2Tゲノムを組み立て、ゲノムの連続性を大幅に向上させました。研究者らは、6,649,674の一塩基多型（SNP）を特定し、173のアクセスションでGWASを実施し、1,937のSNPを28の果実品質特性に関連する1,039の遺伝子に結びつけました。特に、染色体6上のSNPクラスターが果実の色を調節し、アントシアニンの生成を増加させる2つのMYB遺伝子とMLP様タンパク質遺伝子が関与していることが判明しました。
この研究は、将来のヤマモモ育種プログラムに向けた包括的な遺伝資源を提供し、果実の色、サイズ、栄養価といった特性に焦点を当てています。
主任研究者であるシュウウェン・ジャン博士（Shuwen Zhang, PhD）は、「中国のヤマモモの完全な参照ゲノムを組み立てるこの画期的な成果は、遺伝子研究と育種の新しい道を開きます。果実品質特性の遺伝的決定因子に関する我々の発見は、育種プログラムの効率を大幅に向上させ、より良い色、サイズ、栄養プロファイルを持つヤマモモの品種をもたらします」と述べています。
この参照ゲノムの完成と主要な遺伝的変異の特定は、ヤマモモの育種と栽培にとって重要な意味を持ちます。この研究で得られた遺伝的洞察は、分子マーカーの開発を促進し、優れた果実特性の選抜を可能にします。最終的に、この研究は高品質なヤマモモの生産に貢献し、生産者と消費者の双方に利益をもたらします。また、この発見は他の関連種の研究においても貴重な遺伝資源を提供し、園芸ゲノミクスの分野を前進させるものです。
この研究は、ヤマモモ「Zaojia」品種の完全な参照ゲノムの組み立てと、果実品質に影響を与える遺伝因子を明らかにすることで、ヤマモモ育種に新たな道を開きました。特に、果実の色を調節する遺伝子の特定は、将来の育種プログラムにおいて重要な役割を果たすでしょう。この研究は、より良い品質のヤマモモの生産を促進し、消費者と生産者の双方に利益をもたらします。
