【バイオマーケットjp】iRepertoire マルチプレックスPCRプライマーセット TCR/BCRレパトア解析|バイオストリーム

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iRepertoire マルチプレックスPCRプライマーセット

TCR/BCRレパトア解析

出展企業：バイオストリーム株式会社

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次世代シーケンスによる免疫レパトア解析
iRepertoire マルチプレックスPCRプライマーセットのイメージ
iRepertoire マルチプレックスPCRプライマーセット

TおよびBリンパ球抗原受容体（TCR・BCR）の多様性は、多くの遺伝子セグメントの再構成によって体細胞レベルで生成されます。

これらの遺伝子セグメント：V (variable), D (diversity), J (joining), そして C (constant)は、結合特異性と免疫グロブリンおよびTCRのダウンストリームにおける適用性を決定しています。

受容体のV(D)J遺伝子再構成領域は、エピトープ認識の要素として注目されています。 V(D)Jは、アミノ酸配列に翻訳されると、V領域のリーダー配列からなる幾つかの部分：フレームワーク（FR）1、相補性決定領域1（CDR1）、FR2、CDR2、 FR3、CDR3、FR4、およびCドメイン（下図参照）に分割することができますが、その中でもCDR3領域は抗原特異性に関与しているとされ特に注目されています。

近年の次世代シーケンス技術の登場により、多数の塩基配列をパラレルかつ高速に決定することが可能になりました。

そこでiRepertoire社では、ヒト・マウス免疫細胞のCDR3を中心とした領域を次世代シーケンサーで網羅的に解析するためのシステム（試薬および専用データ解析）を開発しました。

本製品を使用することで、疾患と免疫レパトアの関係を自在に解析することができます。

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lifescience products

iRepertoire マルチプレックスPCRプライマーセットの特徴

各受容体の遺伝子解析に最適化された数百ものプライマーセット 特許のarm-PCRによる、半定量的なマルチプレックスPCR PCRによる簡単な次世代シーケンス用ライブラリ調製 次世代シーケンス用ライブラリ調製の自動化にも対応 専用データ解析サービスを無償で提供

会社紹介

iRepertoire Inc. は、最先端の免疫レパトアのシーケンス解析を提供する企業として、 2009年にthe HudsonAlpha Institute for Biotechnologyの中に設立されました。 CEOのJian Hanは、arm-PCRに関する特許 (US patent no. 7,999,092)、 および免疫レパトアを評価し、比較することに関する特許 (US patent no. 9,012,148) を取得しています。

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テクノロジーの原理

免疫レパトアの多様性を創出する仕組み
遺伝子再構成について（BCR＝免疫グロブリンの場合）

次世代シーケンサー免疫レパートリープライマーセット


arm-PCRテクノロジー
網羅的かつ半定量的な2ステップのマルチプレックスPCRにより、多様性に富む各受容体遺伝子を効率的にエンリッチし、次世代シーケンス用ライブラリを調製


iRweb: 専用データ解析サービス
iRepertoire社にシーケンスデータ（FASTQファイル）を送付し、専用パイプラインで解析
結果は専用ウェブサイトから閲覧、ダウンロード可能

iR-Processor: 次世代シーケンス用ライブラリ調製を自動化
必要試薬が封入されたiRockカセット（下記製品参照）を使用すると、Illumina MiSeqでシーケンス可能なライブラリが7～8時間で完成
1台のiR-Processorで4つまでのiRockカセットに対応


iRepertoireプライマーシステムの概要

次世代シーケンサー免疫レパートリープライマーセット



下記製品は、次世代シーケンス解析のための、一般のPCR装置を用いるライブラリ調製用プライマーセット、プライマーと酵素類がパッケージになったキット（iR-Profile）およびライブラリ自動調製システム（iR-ProcessorおよびiRock）です。
 

本ページ記載の会社名・製品名等は各社の商標または登録商標です。

iRepertoire マルチプレックスPCRプライマーセット関連製品

ヒトT細胞, Illumina 100/150PER用プライマーセット

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HTBlvc-X-P Human TCR beta, Illumina
HTDGI-X-P Human TCR delta/gamma, Illumina

ヒトB細胞, Illumina 100/150PER用プライマーセット

HBHIvc-X-P Human BCR Heavy chain, Illumina
HBKLIvc-X-P Human BCR Light chain, Illumina

ヒトT細胞, Illumina MiSeq 250PER用プライマーセット

HTAI-M-X-P Human TCR alpha, Illumina MiSeq
HTBl-M-X-P Human TCR beta, Illumina MiSeq
HTDGI-M-X-P Human TCR delta/gamma, Illumina MiSeq

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HBHI-M-X-P Human BCR Heavy chain, Illumina MiSeq
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iR-ProcessorおよびiRock

・HTBI、HTAI、HBHI、またはHBKLIプライマーセットと必要な試薬類が専用カセット（iRock）にプレロード
・iR-ProcessorとiRockの組み合わせで上記プライマー・セットを用いたNGSライブラリ調製が自動で行えます。

iR-Profile

・TCR（alpha, beta, delta, gamma）、BCR（heavy, light chain）のプライマーより1種類を選択
・1反応分ずつ異なるバーコードをご用意（バーコードは選択できません）
・ライブラリ作製に必要な酵素・試薬および精製用ビーズも含まれています
・10反応/キット
・Human/Mouse（Illumina 250 PER用）

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