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Dynamics of TCR repertoire and T cell function in COVID-19 convalescent individuals


Posted: 2021-09-28 19:00:00
SARS-CoV-2 outbreak has been declared by World Health Organization as a worldwide pandemic. However, there are many unknowns about the antigen-specific T-cell-mediated immune responses to SARS-CoV-2 infection. Here, we present both single-cell TCR-seq and RNA-seq to analyze the dynamics of TCR repertoire and immune metabolic functions of blood T cells collected from recently discharged COVID-19 patients. We found that while the diversity of TCR repertoire was increased in discharged patients, it returned to basal level ~1 week after becoming virus-free. The dynamics of T cell repertoire correlated with a profound shift of gene signatures from antiviral response to metabolism adaptation. We also demonstrated that the top expanded T cell clones (~10% of total T cells) display the key anti-viral features in CD8+ T cells, confirming a critical role of antigen-specific T cells in fighting against SARS-CoV-2. Our work provides a basis for further analysis of adaptive immunity in COVID-19 patients, and also has implications in developing a T-cell-based vaccine for SARS-CoV-2.

参考サイト PubMed: covid-19



バイオクイックニュース日本語版:COVID-19特集

バイオクイックニュース日本語版
6月 06, 2021 バイオアソシエイツ

MIT主導の研究チームがSARS-CoV-2ゲノムの包括的マップを作成

COVID-19 パンデミックが始まってから数カ月後の2020年初頭、科学者らはCOVID-19感染症の原因ウイルスであるSARS-CoV-2の全ゲノム配列を決定することができた。その時点で、その遺伝子の多くはすでに判明していたが、タンパク質をコードする遺伝子の全容は解明されていなかった。今回、MITの研究者らが広範な比較ゲノム研究を行った結果、SARS-CoV-2のゲノムについて、最も正確で完全な遺伝子アノテーションを作成した。 この研究結果は、2021年5月11日にNature…

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